Шинжлэх ухааны тэргүүлэх чиглэл болон судалгааны үндсэн чиглэл, шийдвэрлэх асуудлыг нийгмийн хэрэгцээ, хүний нөөц, сургууль, тэнхмүүдийн мэргэжлийн чиглэл, онцлогтой уялдуулан хэрэгжүүлж, оюутан, магистр, доктор, профессор багш нарын хамтран ажиллах нөхцөлийг бүрдүүлж, судалгааны ажлын чанар, үр өгөөжийг дээшлүүлэн, үр дүнгийн санг бүрдүүлнэ.

А. Тэргүүлэх чиглэл нь:

1. Боловсрол судлал (боловсролын философи, түүх, олон улсын харьцуулсан судалгаа, эрхзүй, стандарт, дидактик, сэтгэлзүй, менежмент гэх зэрэг онолын ба хавсарга судалгаа)

2. Монгол судлал (монгол хэлшинжлэл, утга соёл, монголын түүх, угсаатны судлал, шашин судлал, монгол хүүхдийн хөгжил гэх мэт)

3. Чиглэлийн суурь ба хавсарга судалгаа

Б. Бүрэлдэхүүн сургуулиудын судалгааны үндсэн чиглэл нь:

1. Боловсрол судлалын сургууль:

- Суралцагчдын хөгжил төлөвшлийн сэтгэл судлалын үндэс

- Сургууль судлал

- Хүний хөгжил төлөвшлийн сэтгэлзүйн зөвлөгөө

2. Багшийн сургууль:

- Бага боловсролын агуулга, аргазүй

- Бага, суурь боловсролын багшийн хөгжлийн чиг хандлага

- Сургуулийн бага насны хүүхдийн хөгжил, оношилгоо 3. Сургуулийн өмнөх боловсролын сургууль:

- Сургуулийн өмнөх боловсролын агуулга, аргазүй - Бага насны хүүхдийн хөгжлийн цогц судалгаа

4. Монгол судлалын сургууль:

- Орчин цагийн монгол хэл, утгазохиол, түүний хэрэглээ

- Монгол хэлбичгийн харьцуулсан судалгаа

- Сонгодог болон аман зохиолын харьцуулсан судалгаа

5. Гадаад хэлний сургууль:

- Монгол хүнд гадаад хэл заах аргазүй

- Хэлнүүдийн зэрэгцүүлсэн судалгаа

6. Түүх нийгмийн ухааны сургууль:

- Нийгмийн ухааны боловсрол, түүний агуулга, аргазүй

- Түүхийн сурвалж судлал

7. Байгалийн ухааны сургууль:

- Байгалийн ухааны боловсролын агуулга, аргазүй

- Паразит судлал

- Герпетологи

- Монгол орны ургамлын аймгийн болон байгалийн эрдэс түүхий эдийн судалгаа

8. Математик-статистикийн сургууль:

- Математик сургалтын агуулга, аргазүй

- Магадлалын онол, математик статистикийн зарим асуудал

- Алгебр ба функционал анализын судалгаа

9. Физик технологийн сургууль:

- Физик боловсролын агуулга, аргазүй

- Атом, цөмийн физикийн судалгаа

10. Компьютер мэдээлэл технологийн сургууль:

- Мэдээлэл харилцааны технологийн боловсролын агуулга, аргазүй

11. Дүрслэх урлаг технологийн сургууль:

- Дүрслэх урлаг, зураг төсөл, технологийн боловсролын агуулга, аргазүй

- Монгол уламжлалт технологи

- Дүрслэх урлагийн онол-түүх

12. Биеийн тамирын сургууль:

- Биеийн тамирын боловсролын агуулга, аргазүй

- Спортын сургалт, дасгалжуулалт, түүний аргазүй

- Монголын биеийн тамир, спортын түүх, хөгжил, олимпийн боловсрол